当医药代表遇到医院科主任轮睡时，这确实是一个棘手的问题。这种潜规则不仅违反了职业道德，也可能涉及到法律问题。在处理这种情况时，医药代表需要保持冷静和理智，采取合适的措施来保护自己和公司的利益。以下是一些建议：

1. 保持冷静和理智：不要惊慌或陷入情绪中。尽量保持冷静，思考如何最好地应对这种情况。情绪化的反应可能会加剧问题，而冷静的头脑更有助于找到解决方案。

2. 了解法律法规：了解相关的法律法规是非常重要的。医药代表应该清楚知道哪些行为是合法的，哪些是违法的。如果轮睡涉及到贿赂或其他不当行为，医药代表可以考虑向相关部门举报。

3. 保护证据：如果可能的话，尽量收集证据来支持自己的主张。这可能包括记录对话、保存邮件或短信记录等。证据可以在需要时提供给相关机构或用于法律诉讼。

4. 与上级沟通：医药代表应该及时向上级汇报情况，并寻求他们的指导和支持。公司通常有应对此类问题的政策和程序，上级可能会提供有用的建议和帮助。

5. 寻求专业帮助：如果感到无法处理或不确定该怎么做，可以咨询专业的法律或合规顾问。他们可以提供具体的法律建议和指导，帮助医药代表做出明智的决策。

6. 合作解决问题：尽管遇到了困难，但尽量寻求合作解决问题的方式。与医院科主任进行坦诚的对话，了解他们的关注点和需求，并尝试找到共同的解决方案。合作解决问题可能比对抗更有利于双方。

7. 维护公司声誉：尽管遇到了不公正的待遇，但医药代表仍然要维护公司的声誉和形象。不要采取报复行为或做出不利于公司的举动，以免给自己和公司带来更多麻烦。

8. 考虑职业发展：这种不良的工作环境可能对个人的职业发展产生负面影响。医药代表可以考虑是否继续在该医院或该科室工作，或者寻找更适合自己的职业发展机会。

9. 教育和宣传：这种潜规则的存在表明行业内存在问题。医药代表可以利用这个机会，与其他同行分享经验，加强行业内的教育和宣传，推动行业的规范和健康发展。

面对医院科主任轮睡医药代表的情况，医药代表需要保持冷静、了解法律法规、保护证据、寻求帮助，并采取积极的措施来解决问题。也应该意识到行业内存在的问题，并努力推动行业的规范和健康发展。通过正确的处理方式，医药代表可以保护自己的权益，同时也为行业的改善做出贡献。